GENESEQ, PATGENE ファイル - 完全配列検索、部分配列検索に相補鎖検索オプション追加

GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。
PATGENE ファイルは、世界知的所有権機関 (WIPO) に電子的に提出された核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。

GENESEQ, PATGENE ファイルの完全配列検索、部分配列検索に相補鎖検索オプションが追加されました。

相補鎖のオプション

核酸の完全配列、部分配列検索を行うと、デフォルトでは自動的に相補鎖が含まれます。
相補鎖を含めるかどうかはオプションで変更できます。

- SIN : 入力した配列コードのみの検索
- COM : 入力した配列コードの相補鎖のみを検索
- BOTH : 入力した配列コードとその相補鎖の両方を検索 (デフォルト)

相補鎖オプションの指定方法

相補鎖オプションは　 "-S コード" で指定してください。

<例>

=> FILE GENESEQ

=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN　       ← デフォルトの BOTH (入力したコードと相補鎖) の検索

=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN -S SIN  ← 相補鎖オプションを SIN (入力した配列コードのみ) に変更

=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN -S COM  ← 相補鎖オプションを COM (入力した配列コードの相補鎖のみ) に変更