STNext - Biosequences メニューの強化
2021年4月12日(月)
STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです。
このたび、STNext の Biosequences メニューが強化され、配列質問式のチェック機能が追加されました。
不正な質問式を入力すると、検索前する前に警告が表示され、質問式を修正できるようになりました。
検索可能な配列質問式の形式は下記の通りです。
- BLAST 検索:プレーンテキスト形式、EMBL 形式、GenBank 形式、FASTA 形式
- CDR 検索:FASTA 形式
- モチーフ検索:プレーンテキスト形式
配列質問式中に使用できる文字・記号は下記の通りです。
- BLAST、CDR 検索:A~Z または a~z のアルファベットと 0~9 の数字
- モチーフ検索:A~Z または a~z のアルファベットと 0~9 の数字および下記の記号
{}
[]
^$
,
.
注意:^$ は必ずセットで使用してください。例: ^AAAAAAAAAAAAAA$