STNext - 配列検索のソート、フィルターの強化、ミスマッチ配列のハイライト強化
2021年3月15日(月)
STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです。
このたび、2021 年 2 月に STNext に搭載された新機能 「配列検索」 が更に使いやすくなりました。
ソート項目の追加
ソート項目が追加され、以下の項目の降順または昇順で並べ替えできるようになりました。
- Alignment Identity % : 一致したコード÷類似領域×100
- Query Identity % : 一致したコード÷配列質問式×100
- Subject Identity % : 一致したコード÷回答配列×100
- Query Coverage % : 類似領域÷配列質問式×100
- Subject Coverage % : 類似領域÷回答配列×100
ソート、フィルターの強化
配列検索の結果に適用したソートやフィルターが、他のページに移ったりログオフした後も保持されるようになりました。Motif 検索の場合、ヒットした配列毎に保持されます。
ミスマッチ配列のハイライト
配列質問式とヒットした配列のアライメントで、ミスマッチしたコードが赤くハイライトされるようになりました。また、タンパク質の等価アミノ酸でヒットしたコードは黄色でハイライトされます。
尚、Excel 形式でダウンロードした際も、ハイライトは保持されます。
・例:核酸
・例:タンパク質
・Excel 形式でダウンロード
Biosequences の検索方法の詳細は STNext Biosequence 検索ガイドをご参照ください。