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STNext - 配列検索のソート、フィルターの強化、ミスマッチ配列のハイライト強化

2021年3月15日(月)

STNext

STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです。

このたび、2021 年 2 月に STNext に搭載された新機能 「配列検索」 が更に使いやすくなりました。

ソート項目の追加

ソート項目が追加され、以下の項目の降順または昇順で並べ替えできるようになりました。

  • Alignment Identity % : 一致したコード÷類似領域×100
  • Query Identity %   : 一致したコード÷配列質問式×100
  • Subject Identity %  : 一致したコード÷回答配列×100
  • Query Coverage %   : 類似領域÷配列質問式×100
  • Subject Coverage %  : 類似領域÷回答配列×100
ソート、フィルターの強化

配列検索の結果に適用したソートやフィルターが、他のページに移ったりログオフした後も保持されるようになりました。Motif 検索の場合、ヒットした配列毎に保持されます。

ミスマッチ配列のハイライト

配列質問式とヒットした配列のアライメントで、ミスマッチしたコードが赤くハイライトされるようになりました。また、タンパク質の等価アミノ酸でヒットしたコードは黄色でハイライトされます。
尚、Excel 形式でダウンロードした際も、ハイライトは保持されます。

・例:核酸

・例:タンパク質

・Excel 形式でダウンロード

Biosequences の検索方法の詳細は STNext Biosequence 検索ガイドをご参照ください。