製内件更契約製品の種別結晶構造データベース28ローカルインストールCSD : Cambridge Structural DatabaseIsoStarGOLDHydrate AnalyserCSDとPDBのデータから抽出した非結合原子間相互作用のライブラリー。注目している分子中心（central group）が官能基（contact group）とどのように相互作用しているかを3D分布として表示します。Bioisosteric変換、ドッキング結果の検証、結晶内パッキングの確認等に活躍します。PDB：Protein Data BankGA法に基づいたタンパク質とリガンドのドッキングソフト。CSD中の配座や分子間相互作用を考慮したエネルギー関数を使用することで精度を高めています。精密ドッキングからスクリーニングまで、創薬研究者に定評のあるソフトです。多様な束縛条件、スコア関数、Ensembleドッキングやリスコアも可能です。結晶格子中で水分子が占有できるスペースを計算・表示します。水和物の水素結合ネットワークや水分子の空間環境、水素結合の傾向を考察するのに最適です。Solvate Analyserは、各自で溶媒分子を定義し、パッキングを見やすく表示します。web使用可能機種：Linux、Windows、macOS（一部のソフトのみ）作：ケンブリッジ結晶学データセンター（The Cambridge Crystallographic Data Centre：CCDC、英）容：化合物の名称・分子式、２次元構造図、結合表、３次元原子座標、結晶学データ、書誌情報、実験条件、Drug ID、DOIへのリンクあり数：125 万件（1923〜）（2023 Release）新：年１回。定期的に追加データをダウンロード、年約 6 万件追加頒布形態：ダウンロードまたはUSBメモリ（検索・表示ソフト付）、一部web対応研究者向けCSDのデータを基にした分子ジオメトリーのライブラリー。注目している各部位（結合長、結合角、ねじれ角）を、同様の結合様式を持つ分子構造の実測値のヒストグラムとして表示します。配座の妥当性の確認、PDB中のリガンド構造の確認、最適な配座を持つ分子の設計等に活用されています。CSDやPDBに対し、直感的に条件指定し、 pharmacophore検索の結果がその場で得られるツールです。重原子、水分子などの点定義、芳香環や水素結合などの方向性を持ったfeature定義が可能です。リード化合物の最適化、scaffold変換等、ご活用ください。前述のIsoStarライブラリを基に、分子構造全体で、相互作用が生じやすい場所を立体的に表示し、これらが結晶充填環境で満たされているかどうかを確認できます。対象分子の充塡環境を定性的に評価するのに最適なツールです。年間定額MogulCSD CrossMinerFull Interaction Mapsケンブリッジ結晶構造データベースCCDCのお届けするファクトデータとアプリケーション利用者の対象CSD-CoreCSD-DiscoveryCSD-Materials結晶構造データベースと関連ソフト
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